- Projekt badawczy Program GLOBE
- Otwarta szkoła
- Pracownia informatyki z EFS
- ICIMwB z EFS
- Pracownia komputerowa dla gimnazjum
- Program wymiany uczniów Kotomierz - Bogusław (Ukraina)
- Projekt - Młodzież przyszłością powiatu bydgoskiego
- MCI - Projekt 2009
- Program Indywidualizacji procesu nauczania uczniów klas 1-3 SP
- Przygoda z wiedzą
- Projekt eKotomierz 2010/2011
- Projekt Układanka Genealogiczna
- Edukacja - Marzenie Gimnazjalisty 2014-2015
- Region Nauk Ścisłych 2014 - 2015
- Odkrywamy Planety 2014/2015
- Sztuka Wyboru 2014
- Pracownia komputerowa 2015
Program wymiany uczniów Kotomierz - Bogusław (Ukraina)